ОМ Непростой журнал
Когда речь заходит о секвенировании генома, ученые-романтики любят разбрасываться большими цифрами. UK Biobank, к примеру, обещает расшифровать геномы более 500 000 особей — это как если бы в Исландии было в полтора раза больше жителей, и каждый из них посвятил свою жизнь генетике. На недавней встрече, организованной Smithsonian Initiative on Biodiversity Genomics и китайской биокомпании Shenzhen, группа исследователей повысила ставки до предела: они заявили о намерении вычислить генетический код всей жизни на Земле.
Конечно, на первый взгляд это звучит абсурдно: огромное количество видов живых существ еще даже не открыто, что уж тут говорить о расшифровке генома. Сам по себе план, который пока не имеет финансирования, окрестили Earth BioGenome Project (EBP). Харрис Левин, эволюционный генетик из Калифорнийского университета в Дэвисе, входящий в состав инициативной группы, говорит, что первым шагом на долгом пути EBP станет анализ эукариотов, группы организмов, в которую входят как все растения и животные, так и одноклеточные вроде амеб.
Эта стратегия нашла положительный отклик у аудитории на конференции BioGenomics2017, где эволюционные биологи, экологи и прочие ученые, занятые сохранением видового разнообразия Земли, заинтересовались в применении будущих наработок EBP в своей работе. Оливер Райдер, биологи из Института исследования и охраны природы Сан-Диего, проводит параллели с другим проектом, Human Genome Project, который 30 лет назад тоже начинался как амбициозное и на тот момент технически нереализуемое мероприятие. В конечном итоге это привело не только к первому секвенированию генома человека, но также к появлению совершенно новых ДНК-технологий, который стали основой для огромной промышленной базы, стоимость которой превышает $20 миллиардов. Это был значительный прорыв в биологии, и ученый надеется, что и теперь его коллег ждет успех.
Многие детали EBP все еще на стадии разработки, что неудивительно, учитывая масштаб работ. На данный момент, первый шаг теоретически будет представлять собой детальное изучение ДНК каждого члена эукариотической семьи (всего их порядка 9000), для создания эталонных геномов на том же уровне, что и исследованный на сегодня геном человека. Затем придет черед более секвенирования порядка 150 000 — 200 000 родов. Наконец, участникам EBP удалось бы получить «черновые» геномы 1,5 миллионов оставшихся известных науке эукариот. Соорганизатор мероприятия, Джон Робинсон исследователь поведенческой геномики и директор Института имени Карла Вёзе, отмечает, что это лишь общие черты и по ходу работы ученые будут улучшать те или иные генетические исследования по мере необходимости.
Оптимизм исследователей связан еще и с тем, что стоимость секвенирования генома с каждым годом падает, а потому всю работу можно будет осуществить даже без привлечения астрономических финансовых средств. Калифорнийская компания планирует проводить расшифровку за $100, так что итоговый комплекс будет стоить столько же, сколько в свое время ушло на одну лишь расшифровку генома человека: $4,8 миллиарда долларов, в пересчете на современный курс. При активной финансовой поддержке, ученые планируют завершить проект за 10 лет с момента его старта.
Вы можете подробнее ознакомиться с результатами конференции и экономическими аспектами EBP в статье Элизабет Пенниси на портале Science.
