При помощи методики метагеномного анализа MALT археологи проанализировали кости и зубы из захоронений середины XVI века в Мексике, где хоронили своих мёртвых индейцы племени миштеков. В результате анализа удалось восстановить геном серовара Paratyphi C бактерии Salmonella enterica — возбудителя сальмонеллёза. Исследователи предполагают, что S. enterica, принесённая испанскими колонизаторами, стала причиной массовой гибели индейцев во время эпидемии болезни, которую сами индейцы называли коклитцли (от слова, означающего чума, мор на языках ацтекской группы).
По оценкам историков, до прихода европейцев в Южную Америку численность ее индейского населения составляла около 25 миллионов человек. Спустя 100 лет от огромного народа осталось около миллиона представителей; позже численность индейцев сократилась еще больше.
Основными причинами смертности индейцев стали болезни, принесённые из Старого Света. Одна из самых масштабных эпидемий — болезнь коклитцли — выкашивала индейские поселения с 1540 по 1550-е гг.
Сальмонеллёз — острая кишечная инфекция животных и человека, вызываемая бактериями из рода Salmonella. Как правило, заболевание сопровождается развитием интоксикации и поражением желудочно-кишечного тракта. Человек может быть носителем возбудителя и передавать его другим людям, но при этом не страдать от болезни. Возможно, именно испанцы-носители Salmonella могли передать незнакомый патоген коренному населению Южной Америки и спровоцировать эпидемию.
Препринт статьи опубликован на bioRxiv.org.